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氢原子核外不只一个轨道，氢原子核外有各种轨道已被氢光谱证实。氢原子在稳定状态（基态）下，电子在1s轨道上运动，当 电子从外面获得能量时被激发到较高能量的轨道上。被激发原子不稳定，电子又从能量高的轨道跃入能量较低的轨道，在跃迁时放出能量，发出不同波长的光波。在光谱图上就有不同谱线。
化学反应中氢原子一般只利用了 1s轨道，其他轨道没有被利用。
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