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有机反应的产率往往较低，同时具有一定的可逆性，分水器适用于有机反应中有水生成的可逆反应（如酯化反应），其作用是把反应产生的水从反应体系中分离出来，降低产物的浓度使得平衡正向移动，从而提高反应的产率。
如图8为制备苯甲酸乙酯的实验装置，分水器连接在球形冷凝管和三口烧瓶之间，可以储存冷凝管冷凝的液体，当液面达到支管口时上层的有机层（密度小于水）不断流回到反应瓶中继续反应，而生成的水留在分水器中，打开分水器下口的活塞可以随时除去。
实验中部分有机物易挥发会被蒸出，所以经常需要加入一种与水形成“低共沸点”的物质（这样的物质叫做“水夹带剂”，也可以理解为溶剂），利用水-溶剂共沸物的蒸馏将水带出反应体系。常见的水夹带剂分为两类：一类是密度小于水的夹带剂，如苯、甲苯、二甲苯等；一类是密度大于水的夹带剂，如三氯甲烷、四氯化碳等。水夹带剂不溶于水，可以在分水器中进行油水分离。例如，制备苯甲酸乙酯时，一般加入环己烷，形成“环己烷-乙醇-水”共沸物（沸点62.6℃），环己烷就是实验中的水夹带剂。
普通分水器的使用要求反应物或溶剂和水不互溶，而且一般密度应该比水小，如果反应物或溶剂密度大于水则需要使用改进的分水器，如图9所示。
分水器还可以用于判断反应的终点，反应前在分水器中加入一定量的水，并在反应过程中通过观察分水器中水量的变化来判断反应是否达到终点，这种方法简单易行。
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