氢气不能还原羧基、酯基和酰胺键中间的碳氧双键，主要与它们的结构特点和反应机理有关，具体分析如下：

羧基：

羧基(－COOH)中的碳氧双键由于羰基(C=O)和羟基(－OH)的共同作用，电子云分布较为特殊。

羟基中的氧原子上的孤对电子可以与羰基的π键形成p－π共轭体系。这种共轭效应使得羰基碳上的电子云密度有所增加，其亲电性降低，难以接受氢气提供的电子，所以氢气难以与之发生还原反应。例如，在常见的化学反应条件下，乙酸(CH₃COOH)不会被氢气还原。

酯基：

酯基(－COR)中存在类似的p－π共轭体系。并且，酯基中的烷氧基(－OR)是一个给电子基，它进一步增加了羰基碳的电子云密度，降低了羰基的活性。

以乙酸乙酯(CH₃COOCH₂CH₃)为例，在一般的氢化反应条件下，氢气无法对其酯基中的碳氧双键进行还原。

酰胺键：

酰胺键(－CNH₂)中的氮原子上的孤对电子与羰基形成p－π共轭体系，使得羰基碳的电子云密度增大。同时，由于氮原子的电负性比氧原子小，这种共轭效应比羧基和酯基更强，导致羰基的活性更低。比如，在蛋白质中的酰胺键非常稳定，不会与氢气发生反应。